| 平成13年春 | ２回戦 | ● | 神戸国際大付高２－５市川高 |
| 平成17年春 | １回戦 | ○ | 神戸国際大付高４－１甲府工 |
| ２回戦 | ○ | 神戸国際大付高４－０駒大苫小牧高 | |
| 準々決勝 | ○ | 神戸国際大付高15－１慶応高 | |
| 準決勝 | ● | 神戸国際大付高６－８愛工大名電高 | |
| 平成22年春 | １回戦 | ● | 神戸国際大付高２－３帝京高 |
| 平成26年夏 | １回戦 | ● | 神戸国際大付高１－２聖光学院高 |
| 平成29年春 | １回戦 | ● | 神戸国際大付高１－２東海大福岡高 |
| 平成29年夏 | ２回戦 | ○ | 神戸国際大付高５－４北海高 |
| ３回戦 | ● | 神戸国際大付高１－２天理高(延長11回) | |
| 令和３年春 | １回戦 | ○ | 神戸国際大付高３－２北海高(延長10回) |
| ２回戦 | ● | 神戸国際大付高５－13仙台育英高 | |
| 令和３年夏 | １回戦 | ○ | 神戸国際大付高２－１北海高 |
| ２回戦 | ○ | 神戸国際大付高４－３高川学園高 | |
| ３回戦 | ○ | 神戸国際大付高６－５長崎商(延長10回) | |
| 準々決勝 | ● | 神戸国際大付高６－７近江高 |